Le collezioni del museo raccolgono essenzialmente delle scoperte realizzate nel bacino clermontois e, più in generale, nel dipartimento del Puy-de-Dôme. La loro presentazione permette di delineare la storia delle società che si sono succedute nella Bassa Alvernia a partire dagli elementi di cultura materiale portati alla luce durante gli scavi archeologici.
Il percorso espositivo è organizzato in ordine cronologico. Esso affronta la preistoria (Paleolitica, Neolitica), la protostoria (età del bronzo, età del ferro) e l'antichità gallo-romana. Per ogni periodo, dei focus mettono in luce i luoghi emblematici del territorio. Alcune tematiche, essenziali alla comprensione delle diverse culture (credenze, riti funerari, tecniche...) segnano anche il percorso.