Con i suoi 7 milioni di oggetti, il Museo Nazionale della Preistoria è quello che conserva il maggior numero di oggetti preistorici (utensili e blocchi di pietra tagliata, resti faunistici, oggetti in osso, corna, avorio, mobili e oggetti di arte rupestre, resti umani, ecc.) Questi oggetti provengono da circa 2.500 siti archeologici e sono integrati da archivi scientifici, alcuni dei quali molto antichi. Il loro imballaggio, in 16.000 scaffali, rappresenta più di 8 chilometri lineari.

"Solo" 12.800 oggetti sono esposti in modo permanente nelle sale del museo, vale a dire appena lo 0,2% della collezione totale.

Le collezioni in riserva sono costantemente monitorate: riconciliazione decennale, inventario, ricondizionamento, documentazione, sorveglianza della conservazione, campagne di restauro, ecc. Sono inoltre disponibili quotidianamente per la ricerca, la formazione universitaria e il pubblico, in base al programma culturale del museo e alle richieste di prestito da parte di altri musei.

Il Museo sta uscendo dal suo magazzino! mira a rendere più visibile la ricchezza delle collezioni del museo. Ogni anno, per alcuni mesi, verrà presentata una selezione nell'ambito di un tema specifico e aggiornato. Nell'estate del 2022 sarà messa in luce l'importante collezione di calchi antropologici di Bernard Vandermeersch e Maria-Dolorès Garralda, di cui il Museo Nazionale della Preistoria è stato donatore nel 2020.