La storia di San Pietro il Giovane è segnata da numerose tappe. Inizialmente fondata extra-muros nel VII-VIII secolo, questa chiesa romanica si adorna dello stile gotico nel XIII secolo.
L'edificio conobbe poi un certo numero di rimaneggiamenti, dovuti alla sua trasformazione in chiesa protestante in seguito alla riforma e alla presa di Strasburgo da parte di Luigi XIV. Il «simultaneum» (l'uso della chiesa per i due culti, cattolica e protestante) fu allora in vigore e si prolungherà fino alla fine del XIX secolo.
Il restauro di San Pietro il Giovane è affidato a Carl Schäfer, il cui intervento segna la storia dell'edificio. Dipinge in particolare l'esterno della chiesa ispirandosi a tracce di policromia esterna. Ma questa policromia scompare negli anni sessanta, durante i quali la chiesa è ridipinta in un colore che non è senza evocare l'arenaria rosa dei Vosgi.

Monument historique, Édifice religieux e Patrimoine mondial de l'UNESCO