En 948, Saint-Saturnin (ancien nom de Pont-Saint-Esprit) est devenue la septième « fille » de l’abbaye de Cluny. Son prieur a bâti ce monastère. Le chœur a été rebâti au XIVe siècle et la nef au XVIIIe avant d’être pillée, comme l’ensemble du monastère, à la Révolution. Aujourd’hui, le prieuré est un lieu culturel classé au titre des Monuments historiques en 1988. Le temple protestant est installé à l’emplacement de l’ancienne sacristie.