External seminar – Robert Luallen, San Diego State University
Invited by Grégoire Michaux, Robert Luallen, associate professor of biology, will present his work on the mechanistic characterisation of adhesion and colonisation of the microbiome in the intestine.
Vendredi 10 octobre, 11h00Passé
A mechanistic understanding of microbiome adhesion and colonization in the C. elegans gut
Microbiome bacterial adherence in the gut is a potential host selection mechanism to facilitate microbial retention and colonization, yet the host genes and bacterial factors mediating this process remain poorly understood. By sampling wild C. elegans, we isolated several gut microbiome bacteria that colonize the intestine by attaching to the gut lumen.
Using one of these bacterial species, Lelliottia jeotgali, we have dissected the host and bacterial factors that are required for commensal bacterial attachment and colonization of the gut. On the host side, we found several genes required for microbiome bacterial colonization, including a predicted membrane-bound mucin and secreted VWFA-domain proteins that may form an intestinal scaffold for adherence.
TEM analysis revealed that L. jeotgali attaches to the glycocalyx and induces distinct changes in lumen morphology. On the bacterial side, we found that L. jeotgali species around the world have circulating, conjugative plasmids that are associated with gut colonization. These plasmids encode a type IV pilus and type IV secretion system, which are required for the majority of colonization in C. elegans, suggesting that plasmid-encoded pili enable commensal bacterial adherence in the gut.
Together, our work begins to dissect the factors utilized for microbiome assembly in C. elegans, highlighting an interplay between plasmid-encoded bacterial structures and host-encoded intestinal receptors.
Robert Luallen is an associate professor in the Department of Biology at the San Diego State University.
His areas of expertise include host-microbe interactions, bacterial pathogenesis, gut microbiome, bacterial niche formation, genetics, evolution and innate immunity.
Biology, Health
Séminaire externe – Robert Luallen, San Diego State University
Invité par Grégoire Michaux, Robert Luallen, professeur associé de biologie présentera ses travaux sur la caractérisation mécanistique de l'adhésion & de la colonisation du microbiome dans l'intestin.
Vendredi 10 octobre, 11h00Passé
Caractérisation mécanistique de l'adhésion et de la colonisation du microbiome dans l'intestin de C. elegans
L'adhérence bactérienne du microbiome dans l'intestin est un mécanisme potentiel de sélection de l'hôte qui facilite la rétention et la colonisation microbiennes, mais les gènes de l'hôte et les facteurs bactériens qui interviennent dans ce processus restent mal compris. En prélevant des échantillons de C. elegans sauvages, nous avons isolé plusieurs bactéries du microbiome intestinal qui colonisent l'intestin en se fixant à la lumière intestinale.
À partir de l'une de ces espèces bactériennes, Lelliottia jeotgali, nous avons disséqué les facteurs hôtes et bactériens nécessaires à la fixation et à la colonisation des bactéries commensales dans l'intestin. Du côté de l'hôte, nous avons identifié plusieurs gènes nécessaires à la colonisation bactérienne du microbiome, notamment une mucine membranaire prédite et des protéines sécrétées du domaine VWFA qui pourraient former une structure intestinale favorisant l'adhérence.
L'analyse TEM a révélé que L. jeotgali se fixe au glycocalyx et induit des changements distincts dans la morphologie de la lumière. Du côté bactérien, nous avons découvert que les espèces L. jeotgali à travers le monde possèdent des plasmides conjugatifs circulants associés à la colonisation intestinale. Ces plasmides codent pour un pilus de type IV et un système de sécrétion de type IV, qui sont nécessaires à la majeure partie de la colonisation chez C. elegans, ce qui suggère que les pili codés par les plasmides permettent l'adhérence des bactéries commensales dans l'intestin.
Dans l'ensemble, nos travaux commencent à disséquer les facteurs utilisés pour l'assemblage du microbiome chez C. elegans, mettant en évidence une interaction entre les structures bactériennes codées par les plasmides et les récepteurs intestinaux codés par l'hôte.
Robert Luallen est professeur associé au département de biologie de la faculté des sciences de l’université de San Diego.
Ses domaines d’expertise portent sur les interactions hôte-microbe, pathogenèse bactérienne, microbiome intestinal, formation de niches bactériennes, génétique, évolution, immunité innée.
Biologie, Santé
