Antiguo priorato benedictino del siglo XI, la iglesia de Santiago depende de la abadía de Saint Jouin de Marnes.
Construida bajo el nombre de Santiago El Mayor, esta iglesia es frecuentada regularmente por los peregrinos de Santiago de Compostela llamados los Jacquets.
Esta peregrinación se extiende desde el siglo XI con la reconquista de la Península Ibérica por los cristianos sobre los musulmanes.
Clisson se encuentra a partir de esta época en el itinerario Nantes-Parthenay y la iglesia de Saint Jacques es un relevo para los peregrinos.
La iglesia románica de Santiago data de finales del siglo XII.
Actualmente solo tiene su nave; su ábside, crucero y campanario fueron destruidos en el siglo XIX.
• El edificio es hoy un edificio aproximadamente rectangular orientado de oeste a este. Está sostenido por cinco contrafuertes glacis.
• La fachada que mira hacia el oeste está atravesada por una puerta de arco apuntado, inscrita en el fondo en un arco de mayor alcance, y por encima de una estrecha ventana sacudida.
• El extremo de la nave presenta una gran abertura de arco apuntado, ahora amurallado, antiguo arco triunfal que daba acceso al cuadrado del crucero.
Originalmente, esta iglesia románica, rodeada por un cementerio, era bastante grande y consistía en una nave, dos brazos de crucero, todo cubierto de simples paneles de madera, un ábside abovedado y un campanario cúbico cubierto de tejas y con tres campanas.
• El edificio contenía dos capillas, una a cada lado del arco triunfal; la sacristía estaba detrás de la cabecera.
• La estructura, bastante curiosa, lleva hoy algunos groseros ornamentos y se hace notar por entrantes que parecen salir de las bocas de cocodrilos, esculpidas en cada uno de sus extremos. En uno de los brazos, se poda en la madera la fecha de 1583, año en curso en el que se colocó la carpintería, en sustitución de una más antigua.
• En la nave se encontraba el altar de la cofradía de los Agonizantes. Su retablo estaba adornado con un cuadro que representaba a un enfermo que yacía en su cama, su mujer, un diablo (con su horquilla), sostenido en respeto por San Miguel (armado con una lanza) y un sacerdote. Había que dar un escudo para entrar en la hermandad de los Agonizantes.
 En el momento de la agonía de un colega, la campana sonaba en Santiago: cada uno abandonaba inmediatamente su trabajo y se ponía en oración por el desgraciado que sufría. Cuando un colega había fallecido, uno de sus compañeros, vestido de una dalmática negra adornada con cabezas y huesos de muerte agitando dos campanillas, iba a todas las encrucijadas, anunciando en voz alta la muerte y la hora del entierro del difunto.
 La iglesia de Santiago se convirtió en parroquial en el siglo XV. La parroquia de Santiago no era muy grande y se detenía en la puerta principal de la ciudad cerrada de Clisson (puerta de Santiago).
El 29 de mayo de 1789, el tercer estado de las parroquias de Notre Dame, la Trinidad, St Jacques y St Gilles se reunieron en la iglesia de St Jacques para redactar su cuaderno de quejas.
 Durante el período revolucionario, esta iglesia no fue incendiada. En 1792, se transformó en un templo decreciente, donde se proclamaban leyes y se celebraban bodas. Las estatuas de los santos fueron reemplazadas por dos diosas pintadas sobre tablas de madera, una sosteniendo una balanza y la otra el libro de la ley.
Abandonada a finales del siglo XVIII, la capilla sirvió durante mucho tiempo como depósito para los catadores.
En el siglo XIX sufrió algunas destrucciones (ábside y crucero)
Está inscrita en el Inventario de Monumentos Históricos desde 1941