Situada en la segunda planta, la exposición permanente está dedicada a las colecciones de historia natural.
Se presentan numerosos animales naturalizados, desde artrópodos hasta mamíferos. Los animales están dispuestos siguiendo la clasificación filogenética para permitir a los más jóvenes reconocer las grandes familias y las especies.
Esta exposición también honra la historia natural de la Touraine, con la presentación de rocas, fósiles y estratigrafías originarias de la región.
Los Tourangeaux más nostálgicos podrán encontrar a la antigua estrella del Jardín Botánico: Bobby la foca.
También están presentes otras celebridades del Jardín Botánico de Tours, los osos Willy y Sophie.