La historia de San Pedro el Joven está marcada por numerosas etapas. Originalmente fundada extramuros en los siglos VII-VIII, esta iglesia románica se adorna con el estilo gótico en el siglo XIII.
El edificio fue objeto de varias remodelaciones, debido a su transformación en iglesia protestante tras la reforma y la toma de Estrasburgo por Luis XIV. El «simultaneo» (el uso de la iglesia para los dos cultos, católico y protestante) está entonces en vigor y se prolongará hasta finales del siglo XIX.
La restauración de Saint-Pierre-le-Jeune es confiada a Carl Schäfer, cuya intervención marca la historia del edificio. Pintó sobre todo el exterior de la iglesia inspirándose en las huellas de policromía exterior. Pero esta policromía desaparece en los años 1960, durante los cuales la iglesia se pinta en un color que no deja de evocar el gres rosa de los Vosgos.

Monument historique, Édifice religieux y Patrimoine mondial de l'UNESCO