La Cité des enfants est composé de deux expositions distinctes de part et d'autre du hall d'accueil, l'une pour les enfants de 2 à 7 ans, l'autre pour les enfants de 5 à 12 ans. Clairement délimitées, ces expositions proposent des enjeux et des thèmes de découverte propres à chaque tranche d'âge.
Les plus jeunes aiment surtout agir sur les choses. La Cité des enfants 2-7 ans leur propose cinq thèmes entièrement dédiés à tester leurs capacités, à se découvrir, à agir sur les choses et à interagir avec d'autres enfants : Je sais faire, Je me découvre, Je me repère, J'expérimente et Tous ensemble.
A partir de 5-7 ans, l'enfant s'autonomise et développe une certaine capacité à s'extraire de son environnement immédiat pour raisonner et tenter d'expliquer le monde qui l'entoure.
Cette maturité physique et cognitive est la clé de voûte de la Cité des enfants 5-12 ans. L'initiation à une culture scientifique et technique prend désormais tout son sens.