Le transfert horizontal de gènes est un facteur majeur de l’évolution et de l’adaptation bactériennes, qui leur permet une acquisition rapide de nouveaux caractères comme la résistance aux antibiotiques. Staphylococcus aureus (SA) possède une grande variété de gènes de résistance aux antibiotiques (GRA). Sa capacité à acquérir des GRA est étroitement associée à la grande proportion d’éléments génétiques mobiles (EGM) présents dans son génome (entre 15 à 20%) et à son aptitude à échanger du matériel génétique avec son environnement. À ce jour, peu de données sont disponibles sur la diversité des EGM porteurs de GRA chez les SA, et leur impact sur la dissémination de l’antibiorésistance est peu documenté. Une analyse in silico de 9054 génomes de SA disponibles dans les bases de données NCBI et remplissant des critères de qualité d’assemblage a été réalisée. Une cartographie exhaustive des associations entre EGM, GRA et hôtes a été établie en utilisant les outils ResFinder, RGI- CARD et MEFinder. En parallèle, une analyse in vitro de 267 SA isolés d’animaux au travers du Résapath [1] entre 2010 et 2021 et porteurs de GRA a été menée. Leurs plasmides ont été caractérisés par PFGE et les GRA qu’ils portaient déterminés par PCR et Southern Blot. Enfin, 82 isolats avec des profils d’associations GRA/plasmides d’intérêt ont été séquencés par la méthode Illumina.