Die Entdeckung der Gärten gliedert sich in drei Hauptthemen: Die Botanik und insbesondere die Ethnobotanik, d.h. die Pflanzen, die im Ban de la Roche im 18. Jahrhundert verwendet wurden (Heilpflanzen, Aromapflanzen, kulinarische Pflanzen, Färbemittel....). Die Gestaltung dieses Gartens orientiert sich an den Boxen des Neugierigen Kabinetts von J.F. Oberlin. Pädagogik und Unterricht für Kinder im Zusammenhang mit der Entdeckung der Pflanzenwelt sind mit der Schaffung eines pädagogischen Gemüsegartens verbunden, einer echten Erweiterung des Kinderhauses. Die Kartierung und Beobachtung der Elemente wird im Lustgarten des Pasteurs angeboten. Das Thema der Beobachtung von Planeten und der Verbreitung von Wissen durch Kartographie wird durch Formen von Objekten entwickelt, die in den Sammlungen des Museums vorhanden sind. Ein Obstgarten und eine Wiese vervollständigen diese drei Gärten.