Als die Gouverneure der Kolonie Martinique St. Peter verließen, ließen sie sich zunächst im Fort St. Louis nieder, dessen Residenz der Marquis von Baas 1672 gewesen war. Anschließend bewohnten sie ein großes Holzhaus, in dem sich der alte Regierungspalast befand, der von dem der Kleinen Regierung (dem heutigen Standort der Schelcher-Bibliothek) durch die Regierungsstraße getrennt war, bis zum Bau des neuen Gouverneurshotels von 1923 bis 1928, von dem Architekten Germain Olivier (1869-1942) mit dem Ausführungsarchitekten Paul Fraisse. Es wurde Präfektur während der Präfekturalisierung im März 1946 und wird immer noch von den Dienststellen der Präfektur der Region besetzt.
Die Präfektur ist seit dem 20. März 1990 teilweise unter Denkmalschutz gestellt.