Après avoir essuyé une violente tempête à bord de son voilier sur le Léman, Antoine croit halluciner quand il fait la connaissance de Brume, une surprenante jeune fille qui sillonne les flots à bord d’une « Nautilette », sorte de vélo reposant sur des flotteurs en bois. Elle débute alors le récit de son périple. Grâce à elle, Antoine, narrateur du récit, revisite l’histoire du Léman et des petites îles aux abords de ses rives. Avec Les Mystères du Léman, c’est un vibrant hommage qu'Adrienne Barman et Blaise Hofmann rendent au lac, mais aussi à la nature et à son pouvoir régénérateur.