External seminar - Albert Tsai, Centre de Recherche en Biologie Cellulaire de Montpellier
Invited by Roland Le Borgne, Albert Tsai will present his work on the nuclear organization of transcription in the Drosophila embryo.
Shaping the nucleus for transcriptional and developmental robustness
Precise spatiotemporal patterns of transcription factors (TFs) regulate genes critical for embryo development, instructing cells to differentiate and adopt specific fates. For example, the Homeobox (Hox) TF Ultrabithorax (Ubx) specifies the identity of body segments along the anterior-posterior axis. One of its target genes is shavenbaby (svb) that fates ectodermal cells into trichomes. However, svb enhancers respond to Ubx using low-affinity binding sites and live imaging in embryos suggest that Ubx-DNA interactions last only for a few seconds on average.
Given these stochastic and transient molecular interactions, how can TFs reliably drive gene expression needed for cell-fate determination?
Using super-resolution microscopy, we showed that svb transcription sites sit in Ubx-rich sub-nuclear regions co-enriched for specific transcriptional cofactors, and epigenetic modifications. Genes regulated by Ubx can colocalize to the same environment, improving the robustness of transcription and phenotype development under stress. Over the course of embryogenesis, TF distributions become more heterogeneous and clustered, favoring the forming of localized TF environments later in development.
Understanding how TFs and the chromatin spatially coordinate stochastic and transient molecular interactions into precise and persistent regulatory signals will help decipher how multicellular eukaryotes organize their nucleus to shape their development.
Contact: Roland Le Borgne
Download the poster
Biology i Health
Séminaire externe - Albert Tsai, Centre de Recherche en Biologie Cellulaire de Montpellier
Invité par Roland Le Borgne, Albert Tsai présentera ses travaux sur l'organisation nucléaire de la transcription dans l'embryon de drosophile.
Façonner le noyau pour une robustesse transcriptionnelle et développementale
Des motifs spatiotemporels précis des facteurs de transcription (FT) régulent les gènes essentiels au développement embryonnaire, guidant les cellules vers une différenciation et l’adoption de destins spécifiques. Par exemple, le facteur de transcription à homéoboîte Ultrabithorax (Ubx) détermine l’identité des segments corporels le long de l’axe antéro-postérieur. L’un de ses gènes cibles, shavenbaby (svb), oriente les cellules ectodermiques vers un destin de trichomes. Pourtant, les enhancers de svb interagissent avec Ubx via des sites de liaison de faible affinité, et des observations en imagerie in vivo chez l’embryon révèlent que les interactions Ubx-ADN durent en moyenne seulement quelques secondes.
Comment, malgré ces interactions moléculaires stochastiques et transitoires, les FT peuvent-ils induire de manière fiable l’expression génique nécessaire à la détermination du destin cellulaire ?
En utilisant la microscopie à super-résolution, nous avons montré que les sites de transcription de svb se situent dans des sous-régions nucléaires enrichies en Ubx, ainsi qu’en cofacteurs transcriptionnels spécifiques et en modifications épigénétiques. Les gènes régulés par Ubx peuvent co-localiser dans ce même microenvironnement, améliorant ainsi la robustesse de la transcription et du développement phénotypique, même en conditions de stress. Au cours de l’embryogenèse, la distribution des FT devient progressivement plus hétérogène et groupée, favorisant la formation de microenvironnements localisés de FT aux stades tardifs du développement.
Comprendre comment les FT et la chromatine coordonnent spatialement des interactions moléculaires stochastiques et transitoires en signaux régulateurs précis et persistants permettra de décrypter comment les eucaryotes multicellulaires organisent leur noyau pour façonner leur développement.
Contact : Roland Le Borgne
Biologie i Santé
