Thesis defense - Yanis Si Ahmed
Identification of circular RNAs involved in resistance to targeted therapies in cutaneous melanoma
Mardi 11 février, 14h00Tremenet
Under the supervision of Sébastien Corre & Yuna Blum
Presentation summary:
This thesis investigates the mechanisms of resistance to BRAF inhibitors in BRAF-mutant melanoma, with a particular focus on the pivotal role of circular RNAs (circRNAs). Using an integrative transcriptomic approach and the CirScan tool, a global circRNA-miRNA-mRNA network was identified. Through a supervised approach, I specifically explored a subnetwork involving key circRNAs (circ_1610, circ_2805, circ_5260, circ_5311, and circ_443) acting as sponges for miRNAs such as miR-29, miR-151, miR-148, and miR-221, thereby regulating the expression of major resistance genes (AhR, AXL, and EGFR).
My research demonstrates that these circRNAs play a crucial role in vemurafenib resistance and in the invasive phenotype of resistant melanoma cell lines. Functional in vitro validations reveal that stable depletion of these circRNAs restores sensitivity to BRAF inhibitors and significantly reduces tumor cell invasiveness. These findings highlight the critical involvement of circRNAs in cellular plasticity and the acquisition of therapeutic resistance, paving the way for novel targeted strategies that exploit these non-coding RNAs to enhance treatment efficacy in metastatic melanoma.
Composition of the jury
- Dr. Fabienne MEGGETTO, DR, U1037-Inserm/U5071-CNRS/Université Paul Sabatier, (CRCT)
- Dr. Mehdi KHALED, CR, Gustave Roussy, Université de Paris-Saclay
- Dr. Catherine ANDRÉ, DR, UMR6290 CNRS/Université de Rennes-ERL U1305 Inserm
- Dr. Cyril BOURGEOIS, CR, UMR 5239-INSERM 1293/ École Normale Supérieure de Lyon
- Pr. Marie-Dominique GALIBERT, PU-PH UMR6290 CNRS/Université de Rennes-ERL U1305 Inserm
Biology & Health
Soutenance de thèse - Yanis Si Ahmed
Identification d'ARN circulaires impliqués dans la résistance aux thérapies ciblées dans le mélanome cutané
Mardi 11 février, 14h00Tremenet
Sous la direction de Sébastien Corre & Yuna Blum
Résumé de la présentation
Cette thèse explore les mécanismes de résistance aux inhibiteurs de BRAF dans le mélanome muté BRAF, en mettant en lumière le rôle clé des ARN circulaires (circARN). Grâce à une approche intégrative combinant analyses transcriptomiques et l’outil CirScan, un réseau global circARN-miARN-ARNm a été identifié. En adoptant une approche supervisée, j’ai focalisé mon étude sur un sous-réseau impliquant des circARN spécifiques (circ_1610, circ_2805, circ_5260, circ_5311 et circ_443) agissant comme éponges des miARN miR-29, miR-151, miR-148 et miR-221, modulant ainsi l’expression de gènes de résistance majeurs (AhR, AXL et EGFR).
Mes travaux démontrent que ces circARN jouent un rôle déterminant dans la résistance au vemurafenib et dans le phénotype invasif des lignées de mélanome résistantes. Les validations fonctionnelles in vitro révèlent que la déplétion stable de ces circARN restaure la sensibilité aux inhibiteurs de BRAF et réduit significativement les capacités invasives des cellules tumorales. Ces résultats soulignent l’importance des circARN dans la plasticité cellulaire et l’acquisition de la résistance thérapeutique, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour le développement de stratégies ciblées visant ces ARN non codants afin d’améliorer l’efficacité des traitements du mélanome métastatique.
Composition du jury
- Dr. Fabienne MEGGETTO, DR, U1037-Inserm/U5071-CNRS/Université Paul Sabatier, (CRCT)
- Dr. Mehdi KHALED, CR, Gustave Roussy, Université de Paris-Saclay
- Dr. Catherine ANDRÉ, DR, UMR6290 CNRS/Université de Rennes-ERL U1305 Inserm
- Dr. Cyril BOURGEOIS, CR, UMR 5239-INSERM 1293/ École Normale Supérieure de Lyon
- Pr. Marie-Dominique GALIBERT, PU-PH UMR6290 CNRS/Université de Rennes-ERL U1305 Inserm
Biologie & Santé
